Virus

Result for "Virus"...

Taxonavigation

(Unranked): Virus
Realms: AdnaviriaDuplodnaviriaMonodnaviriaRiboviriaRibozyviriaVaridnaviria
Regna: Bamfordvirae – Helvetiavirae – Heunggongvirae – Loebvirae – Orthornavirae – Pararnavirae – Sangervirae – Shotokuvirae – TrapaviraeZilligvirae
Phyla: Artverviricota – Cossaviricota – Cressdnaviricota – Dividoviricota – Duplornaviricota – Hofneiviricota – Kitrinoviricota – Lenarviricota – Negarnaviricota – Nucleocytoviricota – Peploviricota – Phixviricota – Pisuviricota – Preplasmiviricota – Saleviricota – Uroviricota

Subphyla: Haploviricotina – Polyploviricotina

Classes: Allassoviricetes – Alsuviricetes – Amabiliviricetes – Arfiviricetes – Caudoviricetes – Chunqiuviricetes – Duplopiviricetes – Ellioviricetes – Faserviricetes – Flasuviricetes – Insthoviricetes – Herviviricetes – Howeltoviricetes – Huolimaviricetes – Laserviricetes – Magsaviricetes – Malgrandaviricetes – Maveriviricetes – Megaviricetes – Miaviricetes – Milneviricetes – Monjiviricetes – Mouviricetes – Papovaviricetes – Pisoniviricetes – Pokkesviricetes – Quintoviricetes – Repensiviricetes – Revtraviricetes – Stelpaviricetes – Tectiliviricetes – Tolucaviricetes – Vidaverviricetes – Yunchangviricetes

Ordines: Caudovirales – Herpesvirales – Ligamenvirales – Nidovirales – Ortervirales – Picornavirales – Tymovirales

Familiae: Adenoviridae – Alphasatellitidae – Alphatetraviridae – Alvernaviridae – Amalgaviridae – Ampullaviridae – Anelloviridae – Ascoviridae – Asfarviridae – Astroviridae – Avsunviroidae – Bacilladnaviridae – Baculoviridae – Barnaviridae – Benyviridae – Bicaudaviridae – Bidnaviridae – Birnaviridae – Bromoviridae – Caliciviridae – Carmotetraviridae – Chrysoviridae – Circoviridae – Clavaviridae – Closteroviridae – Corticoviridae – Cystoviridae – Endornaviridae – Flaviviridae – Fuselloviridae – Geminiviridae – Genomoviridae – Globuloviridae – Guttaviridae – Hepadnaviridae – Hepeviridae – Hypoviridae – Hytrosaviridae – Inoviridae – Iridoviridae – Lavidaviridae – Leviviridae – Luteoviridae – Marseilleviridae – Megabirnaviridae – Microviridae – Mimiviridae – Mycodnaviridae – Nanoviridae – Narnaviridae – Nimaviridae – Nodaviridae – Nudiviridae – Papillomaviridae – Partitiviridae – Parvoviridae – Permutotetraviridae – Phycodnaviridae – Picobirnaviridae – Plasmaviridae – Pleolipoviridae – Polydnaviridae – Polyomaviridae – Portogloboviridae – Pospiviroidae – Potyviridae – Poxviridae – Quadriviridae – Reoviridae – Sarthroviridae – Smacoviridae – Solemoviridae – Solinviviridae – Sphaerolipoviridae – Spiraviridae – Tectiviridae – Togaviridae – Tolecusatellitidae – Tombusviridae – Totiviridae – Tristromaviridae – Turriviridae – Virgaviridae

Genera: Albetovirus – Aumaivirus – Blunervirus – Botybirnavirus – Cilevirus – Deltavirus – Dinodnavirus – Higrevirus – Idaeovirus – Ourmiavirus – Papanivirus – Rhizidiovirus – Salterprovirus – Sinaivirus – Virtovirus


Baltimore Classification: Group I: dsDNA – Group II: ssDNA – Group III: dsRNA – Group IV: ssRNA(+) – Group V: ssRNA(-) – Group VI: ssRNA(RT) – Group VII: dsDNA(RT)


Subviral agents (King et al. 2011): Satellites and other virus-dependent nucleic acids – Viroids – Prions

Name

  • Aphanobionta Novak, 1930, Rothmaler, 1951
  • Aphanobiontidea Walton, 1930
  • Archaeophyta Barkley, 1939 non Archephyta Haeckel, 1866
  • Vira Holmes, 1939
  • Viriphyta McKinney, 1944
  • Virales Holmes, 1948
  • Archetista Jahn & Jahn, 1949
  • Vireae Barkley, 1949
  • Acellularae Traub, 1963
  • Protobiota Hsen-Hsu, 1965
  • Vira Barkley, 1970
  • Acytota Jeffrey, 1971
  • Akamara Hurst, 2000

References

  • Gibbs, A. J. 2013. Viral taxonomy needs a spring clean; its exploration era is over. Virology Journal 10:254, (PDF).
  • Collier, Leslie, Balows, Albert & Sussman, Max 1998. Topley and Wilson's Microbiology and Microbial Infections ninth edition, Volume 1, Virology, volume editors: Mahy, Brian and Collier, Leslie. Arnold. ISBN 0340663162.
  • Dimmock, N.J., Easton, Andrew J. & Leppard, Keith 2007. Introduction to Modern Virology sixth edition, Blackwell Publishing, ISBN 1405136456.
  • Knipe, David M., Howley, Peter M., Griffin, Diane E., Lamb, Robert A., Martin, Malcolm A, Roizman, Bernard & Straus Stephen E. 2007. Fields Virology Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 0781760607.
  • Shors, Teri 2008. Understanding Viruses. Jones and Bartlett Publishers. ISBN 0763729329.

Links

  • ICTV Virus Taxonomy 2019
  • Ninth Report of the ICTV 2011 (Fulltext)
  • Viralzone
  • Viralzone: Baltimore classification
  • Virus – Taxon details on National Center for Biotechnology Information (NCBI).
  • Alphabetical list of virus species

Vernacular names


Alternative classifications

Novák (1930)

Novák, F. A. 1930, 1940. Systematická botanika, 2. svazky, in: Rostlinopis, Prag.

  • Akaryonta
    • Aphanobionta
  • Karyonta

Walton (1930)

Walton, Lee Barker 1930. Studies concerning organisms occurring in water supplies with particular reference to those found in Ohio. Ohio Biological Survey Bulletin, 24: 1–86, link.

Kingdom Bionta

  • Subkingdom Protistodeae
    • Phylum Probiontaria
      • Class Microbiontoidea
        • Order Aphanobiontidea
        • Order Chlamydozoidea
      • Class Bacterioidea
      • Class Spirochaetoidea
  • Subkingdom Metaphytodeae
  • Subkingdom Metazoodeae

Holmes in Breed et al. (1948)

Holmes, F.O. 1948. Order Virales: the filterable viruses. In: Breed, R.S., Murray, E.G.D. & Hitchens, A.P. (eds). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, 6th ed. The Williams and Wilkins Co., Baltimore, Bergey's manual of determinative bacteriology, The Outline Classification used in The Bergey Manual of Determinative Bacteriology.

Division Schizophyta

  • Supplements: groups of uncertain relationship
    • Order Virales Breed, Murray & Hitchens, 1944
      • Suborder 1. Phagineae Holmes
        • Family I. Phagaceae Holmes
          • Genus I. Phagus Holmes
      • Suborder II. Phytophagineae Holmes
        • Family I. Chlorogenaceae Holmes
          • Genus I. Chlorogenus Holmes
          • Genus II. Carpophthora McKinney
          • Genus III. Morsus Holmes
          • Genus IV. Aureogenus Black
          • Genus V. Galla Holmes
          • Genus VI. Fractilinae McKinney
        • Family II. Marmoraceae Holmes
          • Genus I. Marmor Holmes
          • Genus II. Acrogenus Holmes
          • Genus III. Corium Holmes
          • Genus IV. Nanus Holmes
          • Genus V. Rimocortius Milbrath & Zeller
          • Genus VI. Adelonosus Brierley & Smith
        • Family III. Annulaceae Holmes
          • Genus I. Annulus Holmes
        • Family IV. Rugaceae Holmes
          • Genus I. Ruga Holmes
        • Family V. Savoiaceae Holmes
          • Genus I. Savoia Holmes
        • Family VI. Lethaceae Holmes
          • Genus I. Lethum Holmes
      • Suborder III. Zoophagineae Holmes
        • Family I. Borrelinaceae Holmes
          • Genus I. Borrelina Holmes
          • Genus II. Morator Holmes
        • Family II. Borreliotaceae Holmes
          • Genus I. Borreliota Goodpasture
          • Genus II. Briareus Holmes
          • Genus III. Scelus Holmes
          • Genus IV. Hostis Holmes
          • Genus V. Moliler Holmes
        • Family III. Erronaceae Holmes
          • Genus I. Erro Holmes
          • Genus II. Legio Holmes
          • Genus III. Formido Holmes
        • Family IV. Charonaceae Holmes
          • Genus I. Charon Holmes
          • Genus II. Tarpeia Holmes
          • Genus III. Tortor Holmes
        • Family V. Trifuriaceae Holmes
          • Genus I. Trifur Holmes
        • Family VI. Rabulaceae Holmes
          • Genus I. Rabula Holmes

Barkley (1949)

Barkley, Fred A. Un esbozo de clasificación de los organismos. Revista de la Facultad Nacional de Agronomia, Universidad de Antioquia, Medellín. 10: 83–103, (PDF) (Spanish)

  • Mychota (Monera, Anucleobionta)
    • Schizophyta
      • Schizomycophyta (Myxothallophyta)
        • Vireae (Viriphyta)
          • Bacteriophagales (Zoophagi, Phytophagi)
          • Rickettsiales
        • Schyzomycetes (Eubacteriae)
        • Spirochaetae
      • Cyanophyta
  • Protista
  • Euplanta
  • Euanimalia

Rothmaler (1951)

Rothmaler, Werner. 1951. Die Abteilungen und Klassen der Pflanzen. Feddes Rep Spec Nov Reg Veg 3: 256–266, Google Books, Abstract.

  • Aphanobionta Novak (1930) – Virales Holmes (1948) – Vireae Barkley (1949)
    • Virophyta Rothm., nov. div. – Archaeophyta Barkley (1939) non Haeckel (1866)
      • Globullovira Rothm., nov. class.
        • Globullovirea Rothm., nov. subclass.
        • Tesserulovirea Rothm., nov. subclass. – Tesserulata Ruska, 1950
      • Rhabdovira Rothm., nov. class.
    • Phagophyta Rothm., nov. div. – d'Herellata Ruska (1950) – Bakteriophagum d'Herelle
      • Phagovira Rothm., nov. class. – d'Herellata Ruska (1950) – Phagineae Holmes (1948)
    • Cysticetophyta Rothm., nov. div. – Cysticeta Ruska (1950)
      • Cysticetovira Rothm., nov. class. – Cysticetes Ruska, Poppe & Kausche (1947) – Cysticeta Ruska (1950)
  • Akaryobionta
  • Protobionta
  • Cormobionta
  • Gastrobionta

Lwoff, Horne & Tournier (1962)

Lwoff, A., Horne, R. & Tournier, P. 1962. A system of viruses. Cold Spring Harb Symp Quant Biol., 27, 51–55.

Key characteristics for classification:

  • Nucleic acid (RNA or DNA): R or D
    • Capsid symmetry (helical, cubical or dual): H, C or B
      • Presence of a lipid envelope (naked or enveloped): N or E
        • Diameter of capsid, or number of capsomers

Hsen-Hsu (1965)

Hsen-Hsu, Hu. 1965. The major groups of living beings: a new classification. Taxon 14(8): 254–261.

  • Protobiota [including Rickettsiae, viruses and bacteriophages]
  • Cytobiota
    • Bacteriobionta
    • Myxobionta
    • Mycobionta
    • Phytobionta
    • Zoobionta

Baltimore (1971)

Baltimore, D. 1971. Expression of animal virus genomes. Bacteriological Reviews, 35(3), 235, Abstract and PDF

  • Group I: Double-stranded DNA viruses (dsDNA)
  • Group II: Single-stranded DNA viruses (ssDNA)
  • Group III: Double-stranded RNA viruses (dsRNA)
  • Group IV: Single-stranded RNA viruses whose mRNA is identical in base sequence to virion RNA (+ssRNA)
  • Group V: Single-stranded RNA viruses whose genome is complementary in base sequence to the mRNA (-ssRNA)
  • Group VI: Single-stranded RNA viruses that replicate through a DNA intermediate (ssRNA-RT)
  • Group VII: Double-stranded DNA viruses that replicate through a single-stranded RNA intermediate (dsDNA-RT)

Hurst (2000)

Christon J. Hurst 2011. An Introduction to Viral Taxonomy with Emphasis on Animal Hosts and the Proposal of Akamara, a Potential Domain for the Genomic Acellular Agents. Studies in Viral Ecology: Animal Host Systems, Volume 2. DOI: 10.1002/9781118025710.ch2

  • Dominio: Akamara
    • Reino: Euviria
      • Virus
      • Virus satélite
    • Reino: Viroida
      • Viroide
      • Virusoide

King et al. (2011)

King, A. M. Q., Adams, M. J., Carstens, E. B. & Lefkowitz, E. J. (eds). 2011. Virus taxonomy: 9h report of the International Committee on the Taxonomy of Viruses. Elsevier Academic Press, San Diego, Google Books. Partially disponible at: www.ictvonline.org

  • dsDNA viruses
    • Order Caudovirales
    • Order Herpesvirales
    • Unassigned viruses
  • ssDNA viruses
    • Unassigned viruses
  • Reverse transcribing DNA and RNA viruses
    • Unassigned viruses
  • dsRNA viruses
    • Unassigned viruses
  • Negative sense ssRNA viruses
    • Order Mononegavirales
    • Unassigned viruses
  • Positive sense ssRNA viruses
    • Order Nidovirales
    • Order Picornavirales
    • Order Tymovirales
  • Unassigned viruses
  • Subviral agents
    • Satellites and other virus-dependent nucleic acids
    • Viroids
    • Prions


From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by Nelliwinne